歷經(jīng)數(shù)十年的發(fā)展，如今基因測序技術(shù)已經(jīng)在基礎(chǔ)研究、技術(shù)研發(fā)和臨床實踐上得到了廣泛的應(yīng)用，據(jù)預(yù)測，基因測序市場未來五年復(fù)合增長率在35%左右，2022年有望突破300億美元。逐漸完善的檢測技術(shù)和不斷降低的設(shè)備成本使基因測序逐漸普及，這一技術(shù)對生物科技研究和醫(yī)學(xué)界的影響也越來越大。

　　不久前，希望組在Github上線了三代測序數(shù)據(jù)高效糾錯、組裝軟件NextDenovo最新版本V2.0-beta.1，面向全球范圍開源并為學(xué)術(shù)研究和其它非商業(yè)用途免費開放。據(jù)悉，本次希望組發(fā)布的NextDenovo最新版不但解決了現(xiàn)有三代測序數(shù)據(jù)組裝工具資源占用大、運行時間長、組裝質(zhì)量不穩(wěn)定的瓶頸，還實現(xiàn)了單Contig一條染色體和超大型基因組組裝的突破，為利用三代數(shù)據(jù)組裝基因組掃清了組裝算法的障礙。

　　目前華為云基因容器已經(jīng)率先集成了NextDenovo最新版，用戶無需下載源碼、編譯和安裝等復(fù)雜過程，可以直接上傳腳本進行數(shù)據(jù)分析，極大簡化了使用流程，并且免除了后續(xù)資源、應(yīng)用維護的煩惱。

　　華為云推出基因容器服務(wù)GCS，助力行業(yè)突破瓶頸

　　基因測序?qū)γ芗嬎愫秃Ａ繑?shù)據(jù)處理能力有較高的要求，尤其是隨著第三代基因測序技術(shù)的研發(fā)和廣泛應(yīng)用，數(shù)據(jù)量較之第二代有了百倍增長，在呈現(xiàn)更加精準的測序結(jié)果的同時，也給基因測序企業(yè)帶來了算力、存儲能力等IT資源的壓力?；驕y序市場的火爆將這一系列問題逐漸放大，成為阻礙行業(yè)和技術(shù)發(fā)展的“絆腳石”。

　　2018年，華為云全球首家推出了以Kubernetes為基礎(chǔ)的基因容器服務(wù)GCS，將基因測序與容器技術(shù)完美地結(jié)合在了一起。據(jù)悉，基因容器服務(wù)GCS是華為云在Kubernetes封裝了一層關(guān)于基因測序的抽象，讓基因行業(yè)可以迅速部署和使用容器技術(shù)，幫助基因行業(yè)的用戶提高資源利用率，輕松應(yīng)對波峰波谷，降低環(huán)境搭建的復(fù)雜性。

　　具體來講，針對基因行業(yè)普遍存在的工具碎片化、開發(fā)語言多樣、系統(tǒng)維護困難等瓶頸，華為云的基因容器解決方案有“快、省、易、捷”的特點。

　　“快”是指極速測序：GCS支持10萬容器規(guī)模，可以超高并發(fā)運行測序分析流程，大幅縮短測序市場，面對大規(guī)模并發(fā)，得益于高性能容器批量計算平臺Volcano的高效任務(wù)調(diào)度能力，可以避免任務(wù)的死鎖、減少等待時間，進一步提升測序分析效率;

　　“省”來自于華為云的高性價比：算力資源按需、按秒計費，CPU和內(nèi)存則根據(jù)業(yè)務(wù)訴求靈活配比，避免浪費，有效幫助企業(yè)降低成本;

　　“易”在于免運維：基于Severless架構(gòu)的容器服務(wù)，集群資源自動化擴縮容，分析流程根據(jù)預(yù)置規(guī)則可以自動化處罰和執(zhí)行;

　　“捷”則體現(xiàn)在華為云帶來的一站式服務(wù)：將基因測序分析與數(shù)據(jù)挖掘能力統(tǒng)一到一套流程里面，避免多套系統(tǒng)操作帶來的不便。

　　基于輕量級的容器技術(shù)，GCS結(jié)合了大數(shù)據(jù)、深度學(xué)習(xí)算法，為測序廠商提供了靈活可定制的測序流程、秒級可伸縮的高可靠資源和便捷一站式用戶體驗，結(jié)合希望組在基因行業(yè)內(nèi)多年來的業(yè)務(wù)積累，更貼近基因測序行業(yè)客戶的訴求，讓基因測序數(shù)據(jù)的計算更省、更快、更輕松。

　　技術(shù)賦能行業(yè)，助力基因企業(yè)創(chuàng)新發(fā)展

　　據(jù)了解，除希望組外，國內(nèi)基因行業(yè)Top 15的企業(yè)中已經(jīng)有14家采用了華為云的服務(wù)。其中，上海其明信息技術(shù)有限公司在華為云容器CCI支持下，其基因檢測與基因云計算的綜合平臺GCBI已經(jīng)完成了25萬例基因數(shù)據(jù)分析和挖掘，協(xié)作作出1萬多次基于基因信息的臨床決策。數(shù)據(jù)顯示，將業(yè)務(wù)部署在華為云CCI上后，上海其明的實際計算成本降低了30%-50%，實現(xiàn)了K8S和物理資源免運維。

　　不僅如此，在AI輔助病理診斷應(yīng)用開發(fā)方面，華為云還與金域醫(yī)學(xué)合作取得過突破性進展，金域醫(yī)學(xué)病理專家團隊與華為云AI團隊合作，首次基于病理形態(tài)學(xué)，通過深度學(xué)習(xí)技術(shù)，訓(xùn)練出精準、高效的AI輔助宮頸癌篩查模型。該模型在排陰率高于60%的基礎(chǔ)上，陰性片判讀的正確率高于99%。同時，陽性病變的檢出率超過99.9%，是目前國際上已公布的AI輔助宮頸癌篩查的最高水平。

　　華為云致力于做智能世界黑土地，以信息技術(shù)賦能各行各業(yè)，并持續(xù)加大研發(fā)投入，助力千行百業(yè)在5G+云+AI的驅(qū)動下實現(xiàn)轉(zhuǎn)型升級。華為云與基因行業(yè)的跨界結(jié)合幫助基因企業(yè)解決了底層技術(shù)難題，全力聚焦業(yè)務(wù)創(chuàng)新，未來也必將極大地加速基因測序等科學(xué)技術(shù)領(lǐng)域的發(fā)展。

特別提醒：本網(wǎng)內(nèi)容轉(zhuǎn)載自其他媒體，目的在于傳遞更多信息，并不代表本網(wǎng)贊同其觀點。其原創(chuàng)性以及文中陳述文字和內(nèi)容未經(jīng)本站證實，對本文以及其中全部或者部分內(nèi)容、文字的真實性、完整性、及時性本站不作任何保證或承諾，并請自行核實相關(guān)內(nèi)容。本站不承擔此類作品侵權(quán)行為的直接責任及連帶責任。如若本網(wǎng)有任何內(nèi)容侵犯您的權(quán)益，請及時聯(lián)系我們，本站將會在24小時內(nèi)處理完畢。