歷經(jīng)數(shù)十年的發(fā)展，如今基因測(cè)序技術(shù)已經(jīng)在基礎(chǔ)研究、技術(shù)研發(fā)和臨床實(shí)踐上得到了廣泛的應(yīng)用，據(jù)預(yù)測(cè)，基因測(cè)序市場(chǎng)未來(lái)五年復(fù)合增長(zhǎng)率在35%左右，2022年有望突破300億美元。逐漸完善的檢測(cè)技術(shù)和不斷降低的設(shè)備成本使基因測(cè)序逐漸普及，這一技術(shù)對(duì)生物科技研究和醫(yī)學(xué)界的影響也越來(lái)越大。

　　不久前，希望組在Github上線了三代測(cè)序數(shù)據(jù)高效糾錯(cuò)、組裝軟件NextDenovo最新版本V2.0-beta.1，面向全球范圍開(kāi)源并為學(xué)術(shù)研究和其它非商業(yè)用途免費(fèi)開(kāi)放。據(jù)悉，本次希望組發(fā)布的NextDenovo最新版不但解決了現(xiàn)有三代測(cè)序數(shù)據(jù)組裝工具資源占用大、運(yùn)行時(shí)間長(zhǎng)、組裝質(zhì)量不穩(wěn)定的瓶頸，還實(shí)現(xiàn)了單Contig一條染色體和超大型基因組組裝的突破，為利用三代數(shù)據(jù)組裝基因組掃清了組裝算法的障礙。

　　目前華為云基因容器已經(jīng)率先集成了NextDenovo最新版，用戶無(wú)需下載源碼、編譯和安裝等復(fù)雜過(guò)程，可以直接上傳腳本進(jìn)行數(shù)據(jù)分析，極大簡(jiǎn)化了使用流程，并且免除了后續(xù)資源、應(yīng)用維護(hù)的煩惱。

　　華為云推出基因容器服務(wù)GCS，助力行業(yè)突破瓶頸

　　基因測(cè)序?qū)γ芗?jì)算和海量數(shù)據(jù)處理能力有較高的要求，尤其是隨著第三代基因測(cè)序技術(shù)的研發(fā)和廣泛應(yīng)用，數(shù)據(jù)量較之第二代有了百倍增長(zhǎng)，在呈現(xiàn)更加精準(zhǔn)的測(cè)序結(jié)果的同時(shí)，也給基因測(cè)序企業(yè)帶來(lái)了算力、存儲(chǔ)能力等IT資源的壓力?；驕y(cè)序市場(chǎng)的火爆將這一系列問(wèn)題逐漸放大，成為阻礙行業(yè)和技術(shù)發(fā)展的“絆腳石”。

　　2018年，華為云全球首家推出了以Kubernetes為基礎(chǔ)的基因容器服務(wù)GCS，將基因測(cè)序與容器技術(shù)完美地結(jié)合在了一起。據(jù)悉，基因容器服務(wù)GCS是華為云在Kubernetes封裝了一層關(guān)于基因測(cè)序的抽象，讓基因行業(yè)可以迅速部署和使用容器技術(shù)，幫助基因行業(yè)的用戶提高資源利用率，輕松應(yīng)對(duì)波峰波谷，降低環(huán)境搭建的復(fù)雜性。

　　具體來(lái)講，針對(duì)基因行業(yè)普遍存在的工具碎片化、開(kāi)發(fā)語(yǔ)言多樣、系統(tǒng)維護(hù)困難等瓶頸，華為云的基因容器解決方案有“快、省、易、捷”的特點(diǎn)。

　　“快”是指極速測(cè)序：GCS支持10萬(wàn)容器規(guī)模，可以超高并發(fā)運(yùn)行測(cè)序分析流程，大幅縮短測(cè)序市場(chǎng)，面對(duì)大規(guī)模并發(fā)，得益于高性能容器批量計(jì)算平臺(tái)Volcano的高效任務(wù)調(diào)度能力，可以避免任務(wù)的死鎖、減少等待時(shí)間，進(jìn)一步提升測(cè)序分析效率;

　　“省”來(lái)自于華為云的高性價(jià)比：算力資源按需、按秒計(jì)費(fèi)，CPU和內(nèi)存則根據(jù)業(yè)務(wù)訴求靈活配比，避免浪費(fèi)，有效幫助企業(yè)降低成本;

　　“易”在于免運(yùn)維：基于Severless架構(gòu)的容器服務(wù)，集群資源自動(dòng)化擴(kuò)縮容，分析流程根據(jù)預(yù)置規(guī)則可以自動(dòng)化處罰和執(zhí)行;

　　“捷”則體現(xiàn)在華為云帶來(lái)的一站式服務(wù)：將基因測(cè)序分析與數(shù)據(jù)挖掘能力統(tǒng)一到一套流程里面，避免多套系統(tǒng)操作帶來(lái)的不便。

　　基于輕量級(jí)的容器技術(shù)，GCS結(jié)合了大數(shù)據(jù)、深度學(xué)習(xí)算法，為測(cè)序廠商提供了靈活可定制的測(cè)序流程、秒級(jí)可伸縮的高可靠資源和便捷一站式用戶體驗(yàn)，結(jié)合希望組在基因行業(yè)內(nèi)多年來(lái)的業(yè)務(wù)積累，更貼近基因測(cè)序行業(yè)客戶的訴求，讓基因測(cè)序數(shù)據(jù)的計(jì)算更省、更快、更輕松。

　　技術(shù)賦能行業(yè)，助力基因企業(yè)創(chuàng)新發(fā)展

　　據(jù)了解，除希望組外，國(guó)內(nèi)基因行業(yè)Top 15的企業(yè)中已經(jīng)有14家采用了華為云的服務(wù)。其中，上海其明信息技術(shù)有限公司在華為云容器CCI支持下，其基因檢測(cè)與基因云計(jì)算的綜合平臺(tái)GCBI已經(jīng)完成了25萬(wàn)例基因數(shù)據(jù)分析和挖掘，協(xié)作作出1萬(wàn)多次基于基因信息的臨床決策。數(shù)據(jù)顯示，將業(yè)務(wù)部署在華為云CCI上后，上海其明的實(shí)際計(jì)算成本降低了30%-50%，實(shí)現(xiàn)了K8S和物理資源免運(yùn)維。

　　不僅如此，在AI輔助病理診斷應(yīng)用開(kāi)發(fā)方面，華為云還與金域醫(yī)學(xué)合作取得過(guò)突破性進(jìn)展，金域醫(yī)學(xué)病理專家團(tuán)隊(duì)與華為云AI團(tuán)隊(duì)合作，首次基于病理形態(tài)學(xué)，通過(guò)深度學(xué)習(xí)技術(shù)，訓(xùn)練出精準(zhǔn)、高效的AI輔助宮頸癌篩查模型。該模型在排陰率高于60%的基礎(chǔ)上，陰性片判讀的正確率高于99%。同時(shí)，陽(yáng)性病變的檢出率超過(guò)99.9%，是目前國(guó)際上已公布的AI輔助宮頸癌篩查的最高水平。

　　華為云致力于做智能世界黑土地，以信息技術(shù)賦能各行各業(yè)，并持續(xù)加大研發(fā)投入，助力千行百業(yè)在5G+云+AI的驅(qū)動(dòng)下實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型升級(jí)。華為云與基因行業(yè)的跨界結(jié)合幫助基因企業(yè)解決了底層技術(shù)難題，全力聚焦業(yè)務(wù)創(chuàng)新，未來(lái)也必將極大地加速基因測(cè)序等科學(xué)技術(shù)領(lǐng)域的發(fā)展。

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