有些表的數(shù)據(jù)量增長很快,對應SQL掃描了很多無效數(shù)據(jù),導致SQL慢了下來,通過確認之后,這些大表都是一些流水、記錄、日志類型數(shù)據(jù),只需要保留1到3個月,此時需要對表做數(shù)據(jù)清理實現(xiàn)瘦身。
這篇文章我會從InnoDB存儲空間分布,delete對性能的影響,以及優(yōu)化建議方面解釋為什么不建議delete刪除數(shù)據(jù)。
InnoDB存儲架構
從這張圖可以看到,InnoDB存儲結構主要包括兩部分:邏輯存儲結構和物理存儲結構。
邏輯上是由表空間tablespace —> 段segment或者inode —> 區(qū)Extent ——>數(shù)據(jù)頁Page構成,Innodb邏輯管理單位是segment,空間分配的最小單位是extent,每個segment都會從表空間FREE_PAGE中分配32個page,當這32個page不夠用時,會按照以下原則進行擴展:如果當前小于1個extent,則擴展到1個extent;當表空間小于32MB時,每次擴展一個extent;表空間大于32MB,每次擴展4個extent。
物理上主要由系統(tǒng)用戶數(shù)據(jù)文件,日志文件組成,數(shù)據(jù)文件主要存儲MySQL字典數(shù)據(jù)和用戶數(shù)據(jù),日志文件記錄的是data page的變更記錄,用于MySQL Crash時的恢復。
Innodb表空間
InnoDB存儲包括三類表空間:系統(tǒng)表空間,用戶表空間,Undo表空間。
系統(tǒng)表空間: 主要存儲MySQL內部的數(shù)據(jù)字典數(shù)據(jù),如information_schema下的數(shù)據(jù)。
用戶表空間: 當開啟innodb_file_per_table=1時,數(shù)據(jù)表從系統(tǒng)表空間獨立出來存儲在以table_name.ibd命令的數(shù)據(jù)文件中,結構信息存儲在table_name.frm文件中。
Undo表空間: 存儲Undo信息,如快照一致讀和flashback都是利用undo信息。
從MySQL 8.0開始允許用戶自定義表空間,具體語法如下:
CREATE TABLESPACE tablespace_name ADD DATAFILE 'file_name' #數(shù)據(jù)文件名 USE LOGFILE GROUP logfile_group #自定義日志文件組,一般每組2個logfile。 [EXTENT_SIZE [=] extent_size] #區(qū)大小 [INITIAL_SIZE [=] initial_size] #初始化大小 [AUTOEXTEND_SIZE [=] autoextend_size] #自動擴寬尺寸 [MAX_SIZE [=] max_size] #單個文件最大size,最大是32G。 [NODEGROUP [=] nodegroup_id] #節(jié)點組 [WAIT] [COMMENT [=] comment_text] ENGINE [=] engine_name
這樣的好處是可以做到數(shù)據(jù)的冷熱分離,分別用HDD和SSD來存儲,既能實現(xiàn)數(shù)據(jù)的高效訪問,又能節(jié)約成本,比如可以添加兩塊500G硬盤,經(jīng)過創(chuàng)建卷組vg,劃分邏輯卷lv,創(chuàng)建數(shù)據(jù)目錄并mount相應的lv,假設劃分的兩個目錄分別是/hot_data 和 /cold_data。
這樣就可以將核心的業(yè)務表如用戶表,訂單表存儲在高性能SSD盤上,一些日志,流水表存儲在普通的HDD上,主要的操作步驟如下:
#創(chuàng)建熱數(shù)據(jù)表空間 create tablespace tbs_data_hot add datafile '/hot_data/tbs_data_hot01.dbf' max_size 20G; #創(chuàng)建核心業(yè)務表存儲在熱數(shù)據(jù)表空間 create table booking(id bigint not null primary key auto_increment, …… ) tablespace tbs_data_hot; #創(chuàng)建冷數(shù)據(jù)表空間 create tablespace tbs_data_cold add datafile '/hot_data/tbs_data_cold01.dbf' max_size 20G; #創(chuàng)建日志,流水,備份類的表存儲在冷數(shù)據(jù)表空間 create table payment_log(id bigint not null primary key auto_increment, …… ) tablespace tbs_data_cold; #可以移動表到另一個表空間 alter table payment_log tablespace tbs_data_hot;
Inndob存儲分布
創(chuàng)建空表查看空間變化
mysql> create table user(id bigint not null primary key auto_increment, -> name varchar(20) not null default '' comment '姓名', -> age tinyint not null default 0 comment 'age', -> gender char(1) not null default 'M' comment '性別', -> phone varchar(16) not null default '' comment '手機號', -> create_time datetime NOT NULL DEFAULT CURRENT_TIMESTAMP COMMENT '創(chuàng)建時間', -> update_time datetime NOT NULL DEFAULT CURRENT_TIMESTAMP ON UPDATE CURRENT_TIMESTAMP COMMENT '修改時間' -> ) engine = InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COMMENT '用戶信息表'; Query OK, 0 rows affected (0.26 sec)
# ls -lh user1.ibd -rw-r----- 1 mysql mysql 96K Nov 6 12:48 user.ibd
設置參數(shù)innodb_file_per_table=1時,創(chuàng)建表時會自動創(chuàng)建一個segment,同時分配一個extent,包含32個data page的來存儲數(shù)據(jù),這樣創(chuàng)建的空表默認大小就是96KB,extent使用完之后會申請64個連接頁,這樣對于一些小表,或者undo segment,可以在開始時申請較少的空間,節(jié)省磁盤容量的開銷。
# python2 py_innodb_page_info.py -v /data2/mysql/test/user.ibd page offset 00000000, page type <File Space Header> page offset 00000001, page type <Insert Buffer Bitmap> page offset 00000002, page type <File Segment inode> page offset 00000003, page type <B-tree Node>, page level <0000> page offset 00000000, page type <Freshly Allocated Page> page offset 00000000, page type <Freshly Allocated Page> Total number of page: 6: #總共分配的頁數(shù) Freshly Allocated Page: 2 #可用的數(shù)據(jù)頁 Insert Buffer Bitmap: 1 #插入緩沖頁 File Space Header: 1 #文件空間頭 B-tree Node: 1 #數(shù)據(jù)頁 File Segment inode: 1 #文件端inonde,如果是在ibdata1.ibd上會有多個inode。
插入數(shù)據(jù)后的空間變化
mysql> DELIMITER $$ mysql> CREATE PROCEDURE insert_user_data(num INTEGER) -> BEGIN -> DECLARE v_i int unsigned DEFAULT 0; -> set autocommit= 0; -> WHILE v_i < num DO -> insert into user(`name`, age, gender, phone) values (CONCAT('lyn',v_i), mod(v_i,120), 'M', CONCAT('152',ROUND(RAND(1)*100000000))); -> SET v_i = v_i+1; -> END WHILE; -> commit; -> END $$ Query OK, 0 rows affected (0.01 sec) mysql> DELIMITER ; #插入10w數(shù)據(jù) mysql> call insert_user_data(100000); Query OK, 0 rows affected (6.69 sec)
# ls -lh user.ibd -rw-r----- 1 mysql mysql 14M Nov 6 10:58 /data2/mysql/test/user.ibd # python2 py_innodb_page_info.py -v /data2/mysql/test/user.ibd page offset 00000000, page type <File Space Header> page offset 00000001, page type <Insert Buffer Bitmap> page offset 00000002, page type <File Segment inode> page offset 00000003, page type <B-tree Node>, page level <0001> #增加了一個非葉子節(jié)點,樹的高度從1變?yōu)?. ........................................................ page offset 00000000, page type <Freshly Allocated Page> Total number of page: 896: Freshly Allocated Page: 493 Insert Buffer Bitmap: 1 File Space Header: 1 B-tree Node: 400 File Segment inode: 1
delete數(shù)據(jù)后的空間變化
mysql> select min(id),max(id),count(*) from user; +---------+---------+----------+ | min(id) | max(id) | count(*) | +---------+---------+----------+ | 1 | 100000 | 100000 | +---------+---------+----------+ 1 row in set (0.05 sec) #刪除50000條數(shù)據(jù),理論上空間應該從14MB變長7MB左右。 mysql> delete from user limit 50000; Query OK, 50000 rows affected (0.25 sec) #數(shù)據(jù)文件大小依然是14MB,沒有縮小。 # ls -lh /data2/mysql/test/user1.ibd -rw-r----- 1 mysql mysql 14M Nov 6 13:22 /data2/mysql/test/user.ibd #數(shù)據(jù)頁沒有被回收。 # python2 py_innodb_page_info.py -v /data2/mysql/test/user.ibd page offset 00000000, page type <File Space Header> page offset 00000001, page type <Insert Buffer Bitmap> page offset 00000002, page type <File Segment inode> page offset 00000003, page type <B-tree Node>, page level <0001> ........................................................ page offset 00000000, page type <Freshly Allocated Page> Total number of page: 896: Freshly Allocated Page: 493 Insert Buffer Bitmap: 1 File Space Header: 1 B-tree Node: 400 File Segment inode: 1 #在MySQL內部是標記刪除,
mysql> use information_schema; Database changed mysql> SELECT A.SPACE AS TBL_SPACEID, A.TABLE_ID, A.NAME AS TABLE_NAME, FILE_FORMAT, ROW_FORMAT, SPACE_TYPE, B.INDEX_ID , B.NAME AS INDEX_NAME, PAGE_NO, B.TYPE AS INDEX_TYPE FROM INNODB_SYS_TABLES A LEFT JOIN INNODB_SYS_INDEXES B ON A.TABLE_ID =B.TABLE_ID WHERE A.NAME = 'test/user1'; +-------------+----------+------------+-------------+------------+------------+----------+------------+---------+------------+ | TBL_SPACEID | TABLE_ID | TABLE_NAME | FILE_FORMAT | ROW_FORMAT | SPACE_TYPE | INDEX_ID | INDEX_NAME | PAGE_NO | INDEX_TYPE | +-------------+----------+------------+-------------+------------+------------+----------+------------+---------+------------+ | 1283 | 1207 | test/user | Barracuda | Dynamic | Single | 2236 | PRIMARY | 3 | 3 | +-------------+----------+------------+-------------+------------+------------+----------+------------+---------+------------+ 1 row in set (0.01 sec) PAGE_NO = 3 標識B-tree的root page是3號頁,INDEX_TYPE = 3是聚集索引。 INDEX_TYPE取值如下: 0 = nonunique secondary index; 1 = automatically generated clustered index (GEN_CLUST_INDEX); 2 = unique nonclustered index; 3 = clustered index; 32 = full-text index; #收縮空間再后進行觀察
MySQL內部不會真正刪除空間,而且做標記刪除,即將delflag:N修改為delflag:Y,commit之后會會被purge進入刪除鏈表,如果下一次insert更大的記錄,delete之后的空間不會被重用,如果插入的記錄小于等于delete的記錄空會被重用,這塊內容可以通過知數(shù)堂的innblock工具進行分析。
Innodb中的碎片
碎片的產(chǎn)生
我們知道數(shù)據(jù)存儲在文件系統(tǒng)上的,總是不能100%利用分配給它的物理空間,刪除數(shù)據(jù)會在頁面上留下一些”空洞”,或者隨機寫入(聚集索引非線性增加)會導致頁分裂,頁分裂導致頁面的利用空間少于50%,另外對表進行增刪改會引起對應的二級索引值的隨機的增刪改,也會導致索引結構中的數(shù)據(jù)頁面上留下一些"空洞",雖然這些空洞有可能會被重復利用,但終究會導致部分物理空間未被使用,也就是碎片。
同時,即便是設置了填充因子為100%,Innodb也會主動留下page頁面1/16的空間作為預留使用(An innodb_fill_factor setting of 100 leaves 1/16 of the space in clustered index pages free for future index growth)防止update帶來的行溢出。
mysql> select table_schema, -> table_name,ENGINE, -> round(DATA_LENGTH/1024/1024+ INDEX_LENGTH/1024/1024) total_mb,TABLE_ROWS, -> round(DATA_LENGTH/1024/1024) data_mb, round(INDEX_LENGTH/1024/1024) index_mb, round(DATA_FREE/1024/1024) free_mb, round(DATA_FREE/DATA_LENGTH*100,2) free_ratio -> from information_schema.TABLES where TABLE_SCHEMA= 'test' -> and TABLE_NAME= 'user'; +--------------+------------+--------+----------+------------+---------+----------+---------+------------+ | table_schema | table_name | ENGINE | total_mb | TABLE_ROWS | data_mb | index_mb | free_mb | free_ratio | +--------------+------------+--------+----------+------------+---------+----------+---------+------------+ | test | user | InnoDB | 4 | 50000 | 4 | 0 | 6 | 149.42 | +--------------+------------+--------+----------+------------+---------+----------+---------+------------+ 1 row in set (0.00 sec)
其中data_free是分配了未使用的字節(jié)數(shù),并不能說明完全是碎片空間。
碎片的回收
對于InnoDB的表,可以通過以下命令來回收碎片,釋放空間,這個是隨機讀IO操作,會比較耗時,也會阻塞表上正常的DML運行,同時需要占用額外