自舉法Bootstrap是什么
自舉法檢驗(yàn)(Bootstrap)
放回式抽樣統(tǒng)計(jì)法。通過對數(shù)據(jù)集多次重復(fù)取樣,構(gòu)建多個進(jìn)化樹,用來檢驗(yàn)?zāi)闼?jì)算的進(jìn)化樹分支可信度的。
簡單地講就是把序列的位點(diǎn)都重排,重排后的序列再用相同的辦法構(gòu)樹,如果原來樹的分枝在重排后構(gòu)的樹中也出現(xiàn)了,就給這個分枝打上一分,如果沒出現(xiàn)就給0分,這樣經(jīng)過你給定的100-1000次重排構(gòu)樹打分后,每個分枝就都得出分值,計(jì)算機(jī)會給你換算成bootstrap值。
重排的序列有很多組合,值越大說明分枝的可信度越高。一般bootstrap值大于70%時該進(jìn)化分支的存在被認(rèn)為是被引導(dǎo)檢測所支持的。最好根據(jù)數(shù)據(jù)的情況選用不同的構(gòu)樹方法和模型,以期獲得更加可靠的結(jié)果。